La grotte bleue se trouve à trois milles marins à l'ouest de Perast. Cette cavité calcaire possède une entrée immergée qui brille d'un bleu cyan entre 11h00 et 13h00, lorsque la lumière du soleil se réfracte à travers l'eau de mer à l'angle précis requis pour illuminer ses parois de calcite. Découverte par des pêcheurs locaux au début du XXe siècle, la grotte est restée inaccessible aux visiteurs occasionnels jusqu'à ce que des exploitants de bateaux rapides commencent à proposer des départs réguliers à la fin des années 1990. La luminescence bleu électrique de la grotte provient du sable blanc du fond marin qui réfléchit la lumière de midi à travers huit mètres d'eau cristalline de l'Adriatique. Aucun éclairage artificiel n'est installé. L'effet disparaît sous la couverture nuageuse ou en dehors de la fenêtre du zénith solaire. Les excursions en bateau rapide à la grotte bleue de Kotor partent généralement de Perast ou de l'île de Notre-Dame-du-Rocher, un îlot artificiel construit sur un récif submergé il y a plus de cinq siècles. La plupart des itinéraires combinent la grotte bleue avec les tunnels sous-marins de la péninsule de Luštica, trois canaux en béton creusés par la marine yougoslave entre 1969 et 1972 pour abriter les patrouilleurs pendant la guerre froide. Les tunnels ont été déclassifiés en 1991 et ouverts au trafic de plaisance en 2003. Ils restent non éclairés, ce qui oblige les guides à naviguer dans les passages de 50 mètres en utilisant uniquement la lumière du jour provenant des portails d'entrée et de sortie. Certains opérateurs prolongent l'itinéraire jusqu'à la forteresse de Mamula, un fort insulaire austro-hongrois achevé en 1853 et utilisé plus tard comme centre de détention italien pendant la Seconde Guerre mondiale. Les excursions en bateau rapide dans les bouches de Kotor fonctionnent toute l'année, bien que les conditions maritimes limitent les départs hivernaux aux matinées où le vent de bora est calme. La topographie en forme de fjord de la baie — il s'agit techniquement d'un canyon fluvial submergé plutôt que d'un véritable fjord — crée des microclimats qui peuvent modifier la visibilité et la hauteur des vagues en quelques minutes. Les opérateurs détiennent des licences commerciales délivrées par le ministère des Transports et des Affaires maritimes du Monténégro, et tous les navires sont équipés d'une radio VHF, d'une navigation GPS et de gilets de sauvetage certifiés jusqu'à 100 kilogrammes. La durée moyenne de la visite est de 2,5 heures. Les baigneurs ne sont autorisés à l'intérieur de la grotte bleue que lorsque la houle est inférieure à 0,3 mètre, un seuil mesuré quotidiennement par le capitaine du port de Kotor. La hauteur sous plafond de la grotte à marée haute est de 1,8 mètre, ce qui oblige les passagers à se pencher ou à s'agenouiller lors de l'entrée.